UAB开发多基因评分来预测癌症耐药性

星座作者 / 花爷 / 2025-05-28 15:15
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    1937年,富兰克林·罗斯福总统签署了《联合国宪章》《癌症法案》,发起了一个全国性的运动全球抗击这种疾病的努力。87年

  

  1937年,富兰克林·罗斯福总统签署了《联合国宪章》《癌症法案》,发起了一个全国性的运动全球抗击这种疾病的努力。87年后,尽管取得了重大进展,但癌症治疗往往效果不佳,50%至80%的患者没有反应美国每年有超过60万人死于癌症。

  如果临床医生能够预测任何癌症治疗的成功,确保每个病人都得到最有效的治疗,那会怎么样?

  挑战在于这种疾病的多样性。有数百种不同类型的癌症,其特征在于它们起源于特定类型的细胞。即使是同一癌症类型的患者,由于遗传易感性、生活方式和免疫反应等独特因素,也需要个性化治疗。治疗结果-;从完全缓解到对治疗产生耐药性;是不可预测的,因为癌细胞可以通过基因突变对药物产生抗药性,从而使治疗无效。

  为了解决这种复杂性,阿拉巴马大学伯明翰分校的一个研究小组由UAB遗传学系教授兼主席Anindya Dutta博士领导,试图在这种明显的随机性中识别模式。利用已建立的癌细胞数据库-;包括癌症药物敏感性基因组学(GDSC)、癌症治疗反应门户网站(CTRP)和癌症体细胞突变目录(COSMIC -);研究小组调查了不同癌细胞系的“基因表达水平是否与药物反应相关”。

  GDSC和CTRP提供了不同细胞系对各种抗癌药物的敏感性信息,而COSMIC则记录了它们的基因表达。Dutta实验室的Divya Sahu研究了两个数据库中存在的777种癌细胞系,发现了36种与抗癌药物耐药性相关的基因。其中一种基因FAM129B被发现在癌细胞的耐药性中起着特别重要的作用。这一发现与之前对FAM129B的实验研究一致,验证了本UAB研究中采用的分析方法的有效性。

  该研究小组利用与耐药性最相关的36个基因,开发了一个名为UAB36的综合评分。他们发现,与现有的多基因评分相比,多基因评分UAB36与各种抗癌药物的相对耐药性表现出更好的相关性。

  研究人员利用UAB36预测了与乳腺癌对他莫昔芬(一种广泛用于乳腺癌治疗的药物)耐药性相关的基因的表达。与单基因方法相比,UAB36始终显示出更高的疗效。在与乳腺癌细胞中他莫昔芬耐药的相关性方面,UAB36也优于已建立的基因特征,如背书和PAM50。

  当研究人员使用UAB36评分来预测三组接受他莫昔芬治疗的实际乳腺癌患者的预后时,这项研究从细胞系研究跨越到作为预后工具的应用。他们发现,与患者年龄和肿瘤分期无关,UAB36评分高的患者生存率较差,这与该评分预测他莫昔芬耐药性较高的预期一致。高UAB36的肿瘤显示了与多重耐药相关的基因集的富集。这表明UAB36是一种很有前景的生物标志物,可用于预测抗癌药物耐药和不良生存。

  UAB36具有作为个性化医疗工具的潜力,有助于识别他莫昔芬耐药风险较高和生存率较差的患者,这表明这些患者将受益于替代治疗策略。这项研究提供了一个地图,帮助医生选择最好的癌症治疗方法,并预测每个病人的结果,尽管这必须经过前瞻性临床试验的验证。

  除了Dutta,发表在NPJ精密肿瘤学杂志上的“预测乳腺癌耐药和患者预后的多基因评分的发展”研究的作者是UAB遗传学系的Sahu和Isaac Andres Segura Rueda。其他共同作者是Jeffrey Shi和Ajay Chatrath,他们是Dutta在夏洛茨维尔弗吉尼亚大学实验室的前成员。

  支持来自阿拉巴马州乳腺癌研究基金会、癌症基因组云协作支持基金和美国国立卫生研究院CA060499基金。

  在UAB,遗传学、生物化学和分子遗传学是Marnix E. Heersink医学院的院系。

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