来自西奈山伊坎医学院的研究人员介绍了KiNet，这是一个交互式门户网站，旨在探索人类细胞系统中激酶-底物的相互作用。这些相互作用在调节复杂的信号通路中起着至关重要的作用，这些信号通路控制着各种细胞过程，如细胞生长、分化和对环境刺激的反应。
通过整合来自多个公共数据库的数据，KiNet使科学界能够在系统范围内可视化和研究这些相互作用，增强对激酶功能及其在癌症、神经退行性疾病和心血管疾病等疾病中的意义的理解。
KiNet的详细信息发表在npj系统生物学与应用杂志上。
激酶是一种通过在其他蛋白质上添加磷酸基团来修饰蛋白质的酶，这一过程被称为磷酸化。这种修饰调节蛋白质的活性、定位和功能，最终影响各种细胞活动。这些激酶-底物相互作用的破坏通常与疾病有关，使其成为治疗干预的主要目标。
尽管有大量关于激酶及其底物的数据，但这些信息大多分散在多个数据库中，这使得在细胞系统的背景下进行解释具有挑战性。KiNet通过聚合来自主要数据库的数据并为研究人员提供一个用户友好的平台来全面探索这些交互来解决这个问题。
“激酶及其底物在细胞信号通路中至关重要，在系统级背景下可视化这些相互作用的能力为理解它们在健康和疾病中的作用开辟了新的途径，”伊坎西奈山遗传学和基因组科学教授、该论文的共同资深作者Gaurav Pandey博士说。“KiNet不仅汇集了现有数据，还提供了一个互动平台，将促进药物发现和系统级分析。”
KiNet能够可视化激酶-底物相互作用的途径，结构域家族和自定义蛋白集为研究人员提供了一个强大的知识发现工具。通过关注系统背景，例如信号通路中的相互作用网络，用户可以更全面地了解这些重要蛋白质是如何运作的。这种能力具有广泛的应用前景，包括药物发现，其中了解激酶和底物之间的复杂关系可以揭示治疗干预的潜在靶点。
除了用于基础研究之外，KiNet还准备为新疗法的开发做出贡献。由于激酶在癌症等疾病中的核心作用，目前许多药物靶向激酶，其中异常激酶活性驱动肿瘤生长。KiNet的可视化激酶相互作用的交互方法可以帮助研究人员识别新的药物靶点，并了解潜在治疗对复杂信号通路的影响。
“KiNet代表了科学界的独特资源，汇集了不同的数据集，并为可视化激酶-底物相互作用提供了一个可访问的平台，”伊坎西奈山药理学教授、该论文的共同资深作者Avner Schlessinger博士说。“我们预计KiNet将成为推进基础研究和临床应用的宝贵工具，特别是在药物发现和个性化医疗方面。”
更多信息:John A. P. Sekar等人，一个探索激酶-底物相互作用的门户网站，npj系统生物学与应用(2024)。DOI: 10.1038/s41540-024-00442-5由西奈山医院提供引用:新的门户网站授权药物发现，关键激酶-底物相互作用的系统级分析(2024,10月3日)从https://medicalxpress.com/news/2024-10-web-portal-empowers-drug-discovery.html检索2024年10月5日。除为私人学习或研究目的而进行的任何公平交易外，未经书面许可，不得转载任何部分。内容仅供参考之用。
